期防守 、官民同守的二守制度，潘季驯在奏疏中说道：“河防在堤，而守堤在人，有堤不守，守堤无人，与无堤同矣。”要严密监察制度，同时保证大堤的守护。

而护堤则是要求防风固堤 ，扩大沿岸植被覆盖，潘季驯引述前任刘天和的护堤之法：“密栽 芦苇和菱草一一将来衍茁愈番 ，即有风不能成浪 ，此护临水堤之要法也。”用卧柳 、低柳 、编柳 、深柳 、漫柳 、高柳 。前三种功效用来固堤护岸 ，后三种是在植树成活后 ，防风浪冲 击 ，加固堤防。

除此之外，就是加强抢险，由于风浪起会加重水患，所以朝廷把秸秆 、树枝、草篙之类捆成大捆 ，使之漂浮于风浪之上 ，从而减弱水势 。这种方法可以就地选材 ，操作方便 ，并且效果甚佳，潘季驯认为这些物料要提前准备，同时各地方官府要和河道衙门一道，一旦发生水患，就要迅速采取行动，减少水灾带来的损失。

同时抢险的重点在于堵口，潘季驯认为：若上段决溢 ，然决口没有形成水 患 ，可不必立即抢筑 ，等水势势缓再进 行堵塞 。若上段决溢，决口处水患形成，这时必需大力抢救，以防止河出故道造成灾患。潘季驯在奏疏中指出：“治河 决必先疏支河以分水势 ，必塞始决之 口，而下流自止。凡堵口，东西筑台，立表贯索 ，网联巨舰 ，穴而窒之 ，实 以土 ，至决口去窒沉舰 ，压以大扫帚 ，合且复决，连昼夜不息 ，决即塞 ，缭以石堤 ，隐如长虹 。”

在具体的处理办法上，先在决口处两边堵 ，以免决堤处扩大 ，若扩大则堵截使溢水回冲主河道 ，尽量做到决口处 口小尾大，这样可防止滚失，尽量减小河患危害度 。